日本廣島縣人。1911年畢業於東北帝國大學農學科，翌年來臺，於臺灣總督府農事試驗場擔任技手，1914年升任技師。1919年前往歐美各國留學，學習農產品改良技術。1925年年底，赴中國南部、香港、中南半島、馬來西亞、印度、菲律賓、爪哇等地考察農業，回臺後任臺北帝國大學助教授兼總督府中央研究所技師，致力於蓬萊稻的育種研究，1928年以在外研究員身分再度赴歐美留學；同年獲農學博士學位。返臺後，轉任臺北市帝國大學理農學部教授，擔任農學、熱帶農學第三講座；仍兼中央研究所種藝科長。1942年任總督府農事試驗所長。編著有《稻?育種事業》、《臺灣稻之分類》、《水稻耕種法》、《臺灣亞麻的將來》、〈改良蓬萊種的要點及方策〉、〈臺灣稻之育種學研究〉等論著。戰後，磯永吉留在臺灣擔任臺灣省農林廳技術顧問，退休後1956年始返回日本。政府為了酬謝他對臺灣農業的貢獻，特別贈與他三餐足用的蓬萊米，直到辭世為止。由於磯永吉對蓬萊種的培植有卓越貢獻，故被稱為「蓬萊米之父」。
參考資料
〔★興南新聞社，《臺灣人士監》，1943〕〔→農事試驗場、蓬萊米〕
